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北半岛胜利突破，极大地鼓舞了第10兵团指战员的斗志。突击部队不顾疲劳，乘胜连续作战，向敌纵深攻击前进，后续部队源源不断地从各突破口上陆。16日午后，推进到岛腰部的仙洞山、松柏山、园山和薛岭山一线高地，控制了整个北半岛，并以此为依托，向南发展。这时，敌军才醒悟过来，弄清我军的主攻方向是在北面。于是汤恩伯、刘汝明慌忙收罗残部，调集机动部队，穷凶极恶地向北反扑。
位于这些山头中段的松柏山，是通往厦门南北的交通咽喉。16日午前，第274 团攻占了这个山头。午后至黄昏，敌军以一个团的兵力，连续向这里发起五次反扑，均被我英勇的指战员打退。
陆上进攻未得手，敌人又出动了飞机，从陆空同时对我实施攻击。第274 团指战员施放烟幕迷盲飞机的视线，使其无法发挥空中优势。最后，敌人出动了毛森特务营，用六辆美国造十轮大卡车运载，急速由南向松柏山增援。前面的二辆车刚过山口，第274 团的勇士们就用重机枪、冲锋枪等火器射击。战士们说真过瘾，打着了汽车还不算，敌人也没有跑掉几个。松柏山阵地岿然不动。
与此同时，登陆部队在园山、薛岭山等高地也同敌军展开了激烈的争夺战。至16日黄昏，敌人向北反扑的计划彻底破产，南北半岛间的一线高地牢牢地控制在我军手中，连遭痛击的敌人狼狈不堪地向南逃窜。
国民党军在北半岛全线失守，多次反扑又未奏效，便动摇了固守厦门的决心。汤恩伯自知大势已去，便拿报话机直接用明语向兵舰呼叫：“我在厦门港海滩上，立即放小艇来，要快，要快，不然我就要被共军俘虏了。”他像泄了气的皮球，顿失往日的骄横。这时，适逢退潮，小艇难以靠岸，急得他在海滩上团团转，直跺脚。我军从报话机中听到他们的对话。叶飞司令员亲自拿过报话机，命令追击部队迅速向厦门港追击，活捉汤恩伯。但是追击部队只顾一心追击敌人，顾不上向后方联络，报话机呼叫数次不通。汤恩伯在海滩上足足逗留了一个小时才等到小艇，夺海路而逃。
在北线登陆部队勇猛向南追击的同时，第g1师273 团二、三营从厦门岛南面登陆策应。17日晨，二营的两个连顺利登陆，并突人市区，俘获敌军400 余人。鼓浪屿的国民党军见大势已去，纷纷东逃金门。在鼓浪屿北端登陆的二营四连紧追不舍，将来不及逃跑的1400余名敌军全部俘虏。鼓浪屿遂为第31军占领。
至此，厦门岛登陆作战胜利结束。解放军登岛部队经两昼夜奋战，共歼灭敌军2。7 万人，其中俘虏2。5 万人。
厦门岛的解放，结束了16世纪中叶以来西方殖民者和帝国主义列强任意蹂躏厦门的历史，驰名中外的“海上花园”从此回到了人民的怀抱。
金门位于厦门以东，距大陆最近处约5。5 海里。大金门岛面积为124 平方公里，金门县城位于该岛西部。小金门岛面积为15平方公里。此外，尚有大担、二担等几个小岛。大金门东部山高岸陡，不易攀登；西半部地势较平坦，其北岸为泥沙滩，利于登陆，是国民党军的防守重点。岛上除少数要塞工事外，在登陆地段还加修了野战工事，敷设了障碍物。
大小金门原有国民党军第22兵团全部、青年军第201 师及第12兵团第门师防守，共约2 万余人。厦门岛解放后，金门守敌受到很大威胁。国民党军为固守金门，于10月10日后又陆续将潮汕地区的第12兵团所率第18、19军撤于金门，至24日金门敌军的总兵力已增至4 万余人。
厦门解放后，我第10兵团决定以第28、29军各一部共七个团的兵力，在第28军首长指挥下，担任攻取大金门的任务，以第引军一部攻取小金门。稍后，又解除了第31军的任务，决定攻取大小金门统由第28军担负。
第28军受领进攻金门岛的任务后，进行了渡海作战的准备，但沿海船只大部被敌人破坏，征集到的船只仅能装载一个营。在第10兵团的多次督促下，第28军于10月18日下达了攻击大金门岛的部署命令：以第82师全部并指挥第84师第25团、第29军第85师第253 团、第87师第259 团共六个团的兵力，分两个梯队进攻大金门岛；得手后，以第85师两个团攻击小金门岛。定于10月20日发起战斗。
由于船只严重不足，第28军不得不将进攻金门的时间推迟到23日。此时，第10兵团一面催促第28军加紧准备，一面要求集中各军所有船只以保障第28军攻金作战。21日，第10兵团发现国民党军第12兵团部抵达金门湾，其部队由潮州。汕头开始船运。23日，又侦悉该敌第118 师已抵达大金门，后续部队正在海运途中。但第10兵团对该敌是撤回台湾还是增援金门判断不定，因而未采取应变措施。这时，第28军已集中可装载三个团兵力的船只。第10兵团首长认为，必须乘敌增援部队未到达金门之时，抓住战机，发起登陆，攻取金门。第一梯队航渡三个团，返航后第二梯队至少还可航渡两个团，一夜能运过五个团的兵力，敌我力量对比可达1 ：1 ，足可巩固阵地，解决残敌。因此，决心于24日夜发起战斗。
战斗部署是：以第28军第82师第244 团。第84师第251 团、第29军第85师253 团共三个团为第一梯队，由第82师统一指挥，分别自莲河、大瞪岛、沃头东北港湾起渡，在大金门岛北部湖尾乡至古宁头段登陆突破，首先攻歼该岛西半部之敌；尔后会同后续梯队攻歼东半部之敌。预定三天解决战斗。
10月24日晚8 时，第28军指挥第一梯队三个团按预定计划分别从莲河、大瞪岛、后村等地启航。当时天色已晚，海面刮起三四级东北风，潮水徐徐上涨。由于征集的水手都来自福州、泉州等地，不熟悉航道，事先又未经过训练，协同不力，调度不灵。加上第82师指挥所未随船跟进，通信联络不畅，各团即自行航行。接近岛岸时，适逢落潮，又遭敌炮火拦阻，造成部分伤亡。25日2 时许，各团约在10公里的正面上开始登陆突破。第244 团在兰后至龙口段登陆。第251 团先头营于湖尾乡地区顺利登陆，但后续营遭敌炮火袭击，伤亡达三分之一。第253 团在古宁头及其以东地区登陆。登岸后，各部建制混乱，不仅三个团没有统一指挥，各团也未能及时恢复建制，营以上指挥员掌握的部队最多不超过一个连。登岛部队在失去统一指挥，又未巩固滩头阵地的情况下，按照既定的作战方向，在“有几个人打几个人的仗，不等待，不犹豫，向里猛插”的战术思想支配下，向敌纵深穿插。至拂晓前，进至西山、观音亭山、湖尾、湖南高地、安歧、浦头一带。
25日4 时30分，刚抵金门的敌第18军第118 师（欠一个团）及岛上原有的守军两个团，在坦克、炮兵配合下，分三路向登岛部队实施反击。8 时起，又出动空军、海军轰炸登岛部队阵地及未及返航的船只。战斗十分激烈。第244 团团长邢永生身负重伤，仍率领战士顽强抗击。至12时，弹药耗尽，该团人员大部牺牲。第251 团团长刘天祥率主力激战至15时，伤亡近千人，余部冲出重围，至古宁头与第253 团会合。第251 团另一部苦战9 个小时，打垮敌军7 次冲击后，仅存的两个班突围于古宁头，也与第253 团会合。坚守古宁头的第253 团和兄弟部队余部，击退国民党军多次反扑，给敌以重大杀伤。
第一梯队使用的船只，因无人随船指挥返航，登陆后又逢落潮而搁浅，遭国民党空海军轰炸扫射，全部损失，致使第二梯队无船航渡增援。第10兵团下令紧急动员船只。25日，只收集到装载四个连兵力的船只。遂决定由第246 团团长孙玉秀率第246 、259 团各两个连前往增援。由于风浪太大，一部被风吹散，实际登岛只有10个排。苦战终夜，与坚守古宁头的部队会合。
26日拂晓，敌军在坦克、火炮和飞机的配合下，向坚守古宁头的登岛部队猛烈反击。激战至22时，登陆部队利用夜暗向北突围至海连，未寻到船只，遂向东南山区转移。27日下午，在双乳山附近被国民党军发现包围。血战到28日下午，弹尽粮绝，第246 团团长孙玉秀负伤后自尽，其余被俘。
进攻金门岛的战斗，共毙伤国民党军9000余人，但登岛部队共三个多团9086人（内有船工、民夫等350 人）大部壮烈牺牲，一部被俘。这是解放战争中人民解放军的一次重大损失。
金门战斗后，第10兵团专门召开会议进行战役检讨。这次战斗失利的主要教训是：在胜利的形势下，高级指挥员轻敌麻痹，盲目乐观，战斗任务尚未全部完成，就过早地转移了工作重心，忙于城市接管，把攻打金门的指挥责任交给了第28军；对渡海登陆作战的特点和困难认识不足，船只准备不充分；敌情掌握不准确，对国民党军第12兵团两个军增援金门，敌我力量发生重大变化的情况未及时察觉，只强调抓住战机，仍按原计划发起战斗；战斗组织指挥不严密，不同建制的三个团没有统一指挥，仓促发起战斗，这就难以避免造成严重的损失。进攻金门岛战斗虽然失利，但登陆作战的指战员们顽强拼搏，英勇献身的战斗精神是永不磨灭的。
10月29日，中央军委发出（关于攻击金门岛失利的教训的通报），指出：“查此次损失，为解放战争以来之最大者。其主要原因，为轻敌与急躁所致。”“当此整个解放战争结束之期已不在远的时候，各级领导干部中主要是军以上领导干部中容易发生轻敌思想及急躁情绪，必须以金门岛事件引为深戒。对于尚在作战的兵团进行教育，务必力戒轻敌急躁，稳步地有步骤地歼灭残敌，解放全国，是为至要。”
漳厦金战役从9 月19日发起至10月28日结束，共歼国民党军5 万余人，解放了闽南大陆及厦门、大瞪�